Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OCA2Q04671 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OCA2Q04671 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms