Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN2Q02246 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN2Q02246 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms