Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO4P98177 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms