Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms