Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX3P78415 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX3P78415 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX3P78415 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX3P78415 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX3P78415 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX3P78415 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX3P78415 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX3P78415 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX3P78415 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms