Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN10P78369 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN10P78369 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms