Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM193AP78312 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms