Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms