Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms