Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms