Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX2P52951 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms