Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DAP3P51398 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms