Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE6CP51160 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms