Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms