Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLCP48506 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLCP48506 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLCP48506 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLCP48506 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLCP48506 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms