Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRATP43155 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRATP43155 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms