Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms