Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms