Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms