Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms