Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM5P33992 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM5P33992 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM5P33992 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM5P33992 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCM5P33992 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCM5P33992 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCM5P33992 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCM5P33992 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM5P33992 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM5P33992 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms