Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRS3P32247 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRS3P32247 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms