Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HOXD3P31249 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HOXD3P31249 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD3P31249 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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