Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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PTPRMP28827 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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PTPRMP28827 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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PTPRMP28827 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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PTPRMP28827 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
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PTPRMP28827 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRMP28827 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRMP28827 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRMP28827 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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