Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCAP28676 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCAP28676 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms