Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms