Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA4P25789 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms