Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms