Protein–RNA interactions for Protein: P24310

COX7A1, Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7A1P24310 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX7A1P24310 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX7A1P24310 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms