Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRDP23468 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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