Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD247P20963 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD247P20963 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD247P20963 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD247P20963 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD247P20963 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD247P20963 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD247P20963 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD247P20963 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD247P20963 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD247P20963 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD247P20963 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms