Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD53P19397 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD53P19397 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD53P19397 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD53P19397 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD53P19397 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD53P19397 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD53P19397 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD53P19397 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD53P19397 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD53P19397 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD53P19397 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms