Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CTRB1P17538 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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