Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms