Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FDPSP14324 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FDPSP14324 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FDPSP14324 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FDPSP14324 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FDPSP14324 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FDPSP14324 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FDPSP14324 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDPSP14324 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDPSP14324 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FDPSP14324 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDPSP14324 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDPSP14324 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDPSP14324 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDPSP14324 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDPSP14324 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDPSP14324 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms