Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms