Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODC1P11926 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODC1P11926 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODC1P11926 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODC1P11926 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODC1P11926 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODC1P11926 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODC1P11926 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODC1P11926 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODC1P11926 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms