Protein–RNA interactions for Protein: P11309

PIM1, Serine/threonine-protein kinase pim-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM1P11309 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIM1P11309 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIM1P11309 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIM1P11309 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms