Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAMP11215 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms