Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX5BP10606 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms