Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA1P0DJI8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms