Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM228BP0C875 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms