Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIL1P09327 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIL1P09327 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIL1P09327 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VIL1P09327 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIL1P09327 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIL1P09327 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms