Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms