Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMTA2O94983 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMTA2O94983 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms