Protein–RNA interactions for Protein: O75494

SRSF10, Serine/arginine-rich splicing factor 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF10O75494 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF10O75494 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms