Protein–RNA interactions for Protein: O75340

PDCD6, Programmed cell death protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6O75340 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDCD6O75340 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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