Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLXNC1O60486 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms