Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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