Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms